Dans le hall colonial de la chapelle, se trouvaient, encastrés dans le mur, les confessionnaux, à travers lesquels les religieuses pénitentes communiquaient avec le prêtre.
Aujourd’hui dans le grand hall Santa Clara, ancienne chapelle du couvent, on peut apercevoir sur le mur le tracé de l’autel, qui a été transféré à la chapelle de Notre-Dame de Candelaria, au sommet de la colline de La Popa. Les murs de toute la zone coloniale sont très bien conservés, avec une peinture à base de coquille d’œuf.
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